女性多囊卵巢综合征主要的临床表现是月经失调、雄激素过量以及肥胖，月经失调其中是最为主要的症状，多表现为月经稀发，周期有可能短则35日，长则6个月甚至完全的闭经。而在闭经之前常有经量过少或者是月经稀发，也有部分的患者会表现成不规则的子宫出血。另外，生育期的女性会因为排卵障碍而导致不孕症。
对于一些雄激素水平比较高的女性来说，则会表现出不同程度的多毛，尤其是以性毛为主，阴毛浓密而且像男性那样的倾向，延及肛周、腹股沟或者是腹中线。大约50%以上的患者会出现肥胖的症状，而且常常呈现腹部肥胖型，同时也有少部分的患者会出现黑棘皮症，所谓的黑棘皮症就是在阴唇、颈背部、腋下、乳房下以及腹股沟等处皮肤的皱褶部位出现了灰褐色色素沉着。