肛周脓肿有可能会自愈的，如果患者肛周脓肿比较表浅，脓肿比较小，表面皮肤自行破溃，脓肿内部的液体能够流出来，肛周脓肿是有可能会自行愈合。当肛周脓肿愈合以后，有可能会在局部形成肛瘘，所以患者需要到医院来进行检查或者进行复查，如果后期形成肛瘘，还需要行肛瘘切除手术或者行肛瘘挂线手术等等。
但是如果患者肛周脓肿比较大，或者肛周脓肿比较深，不能够自行破溃，就不能够自愈，会出现肛门周围疼痛、发热等情况，建议到医院来检查，需要行脓肿切开排脓或者行脓肿根治手术。