在临床上心动过缓出现的病因可能性很多，最常见的是窦性心动过缓。窦性心动过缓多见于安静或者是睡眠时，尤其是老年人、运动员、重体力劳动者或者是安静睡眠状态时，与迷走神经张力增高有关。
病理性的窦性心动过缓，见于颅内压增高、严重缺氧、甲状腺功能减退、阻塞性黄疸、迷走性晕厥、低温以及应用胆碱能药物、胺碘酮、β受体阻断剂、非二氢吡啶类钙通道阻滞剂，或者是洋地黄等药物。
窦房结的病变和急性下壁心肌梗死，也常发生窦性心动过缓，心脏发生房室传导阻滞时也会出现心动过缓，导致房室传导阻滞的病变，常见的有冠心病、急性心肌梗死、冠状动脉痉挛、心肌炎、心内膜炎、多发性肌炎、心肌病、急性风湿热、主动脉瓣狭窄伴钙化、先天性心血管疾病、原发性高血压、心脏手术损伤、也可能会见于电解质紊乱、药物中毒、黏液性水肿等，老年持续性的房室传导阻滞以原因不明，传导系统的退行性改变多见。