肠套叠的临床症状比较简单，大多是在饱食或者运动以后出现腹痛、腹胀。腹痛、腹胀出现以后会逐渐加重，可以出现的腹痛的情况主要是间断性发作、阵发性发作，腹痛呈绞窄性疼痛，也就是肠子扭着疼，中间可以有不疼的时期。
对于腹胀来说，腹胀会逐渐加重，还会出现停止排便排气或者排便排气减少的情况。如果肠套叠的位置比较高，症状比较重，还可以出现恶心、呕吐的情况，还可以出现水和电解质的紊乱。另外，肠套叠一般是小肠常套到结肠以内，这种情况一旦发现，一定要早期手术治疗。