肠胃不好使用的药物需要根据其病变以及症状决定，首先最常见的是消化不良以及胃肠道功能紊乱，主要症状为进食后出现腹胀、嗳气、恶心、呕吐以及轻度腹痛症状。在治疗上需要给予帮助消化药物，如胃蛋白酶、消食片等，改善胃动力药物，如多潘立酮、莫沙必利等，调整肠道菌群药物，如双歧杆菌、乳酸菌等。其次慢性胃炎也是较常见的肠胃疾病，主要表现为胃部胀满不适，可伴有消化不良。在治疗上主要是给予助消化药物，如胃蛋白酶、消食片等。
最后消化性溃疡也是较常见的胃肠道疾病，主要表现为规律性的上腹部疼痛，可伴有烧心、反酸症状。在治疗上主要给予抑制胃酸药物，如奥美拉唑、泮托拉唑等，保护胃黏膜药物，如胶体果胶铋、枸橼酸铋钾等。如果合并幽门螺杆菌感染，可给予两种抗生素治疗，如阿莫西林、克拉霉素、甲硝唑、呋喃坦啶等。