气管有痰最常见原因是感冒、急性气管及支气管炎、慢性支气管炎、慢性阻塞性肺疾病、支气管扩张、间质性肺病等，上述呼吸系统疾病都可以见到气管有痰。气管有痰若是急性呼吸系统疾病，多为病毒、细菌，或支原体、衣原体等非典型病原微生物感染所引起。如果是病毒感染引起，多会采用抗病毒药物进行治疗，或者使用中医中药辨证治疗。如果是细菌感染引起，可给予抗生素抗感染治疗，常用青霉素类阿莫西林、头孢菌素类头孢呋辛、大环内酯类阿奇霉素等。如果是支原体、衣原体等非典型病原菌感染引起，通常用大环内酯类阿奇霉素等。如果是大于18岁成人，也可以用喹诺酮类抗生素，如莫西沙星等。
如果是慢性呼吸系统疾病，可以采用中医中药辨证治疗。如果是咳嗽、咳黄黏痰，辨证为痰热内蕴，可以给予清肺化痰药物，比如复方鲜竹沥液。如果是痰比较白，伴有食欲不振、大便偏溏，多属于痰浊内蕴，可给予二陈丸进行治疗。如果是阴虚肺燥型咳嗽、咳痰，可以给予百合固金口服液进行养阴润肺治疗。此种阴虚肺燥型咳嗽、咳痰，常见症状是咳嗽、痰比较少，或痰中夹有少许血丝，伴有五心烦热、潮热、盗汗等症状。