焦虑症是一种慢性复发性疾病，在开始服药8-12周的急性治疗期后，还需要服用2-6个月的巩固治疗，再维持治疗至少12个月，所以总的治疗一般在一年半左右。对于惊恐障碍，在急性期治疗8-12周以后，巩固和维持治疗的时间也至少在一年以上，而对于病程长、反复发作、治疗效果不佳，并且伴有抑郁或者有家族史的焦虑抑郁症患者，维持治疗通常需要数年，甚至药物治疗需要维持终身。
因为焦虑症主要是大脑中的一些神经递质代谢紊乱造成的，这些神经递质包括5-羟色胺、多巴胺和肾上腺素。焦虑症主要包括慢性焦虑症，也就是广泛性焦虑障碍，以及急性焦虑症，也就是惊恐障碍。所以，它们的治疗周期不同，但是总体治疗周期至少在12个月以上。