新生儿吃了就吐不一定是消化道有畸形，因为引起呕吐的原因有内科性疾病，也有外科性疾病。内科性疾病常见的有消化道的炎症，如胃肠炎、新生儿坏死性小肠结肠炎等，都可以引起呕吐。
新生儿吃了就吐的情况，要和常见的溢乳相鉴别，溢乳是新生儿期的一种正常生理现象，主要和食道、胃、贲门等括约肌发育不成熟有关。有些疾病是消化道畸形，如小肠闭锁、环状胰腺、坏死性小肠结肠炎等引起的肠梗阻等，这些外科性疾病也会引起呕吐。所以新生儿呕吐要做好鉴别，不一定都是由消化道畸形所引起。