肠镜活检做病理检查，结果是癌症的几率还是比较高的。因为在医生做肠镜的时候，通常在肉眼情况下不能直接判断良性或恶性的疾病，医生采取活检送病理检查来进一步明确诊断。也就是说，如果做肠镜的医生肉眼发现肠道内的病变有癌症可能性的话，会积极的给病人取活检来做病理检查，这样的结果就会使肠镜活检确诊癌症的几率就比较高了。
但是这并不意味着肠镜一旦取了活检做病理就一定是癌症，还有很多的病理回报结果只是肠道息肉或者肠道慢性炎症。所以病理诊断是诊断癌症的金标准，如果诊断良性疾病的话，就不能按照癌症来进行治疗。