子宫内膜异位症是指正常宫腔内的子宫内膜异位到宫腔以外的部位，最常见的就是异位到卵巢上，就会造成卵巢的巧克力囊肿。如果单纯的卵巢巧克力囊肿，很多人可能没有任何症状。
当巧克力囊肿越长越大，造成粘连、破裂，会出现腹痛，有可能出现的就是不孕症，影响了输卵管或者是影响卵巢排卵造成不怀孕。子宫内膜还有最常见的异位到子宫直肠陷凹的位置，也就是子宫直肠窝的位置，叫深部结节型子宫内膜异位症，典型的临床表现就是会出现性交痛，同房的时候会出现疼痛。