口腔内是有菌的环境，如果细菌沉积在牙面上长时间不清除，就会形成菌斑生物膜，菌斑生物膜可以牢固的附着在牙齿表面，当附着时间较长的时候，菌斑生物膜会吸收唾液中的矿物质而形成钙化。
钙化以后形成坚硬的沉积物就是牙结石，刚刚形成的牙结石多呈黄色，质地较软，形成时间较长，以后牙结石可以变成黑色的并且质地较硬，牙结石一般沉积于牙龈缘的附近，可以分为龈上的牙石，以及看不到的根面上的牙齿。
牙石中存在着大量的细菌，细菌可以释放出来侵犯牙龈、牙槽骨以及牙骨质，导致牙周病的发生。所以牙结石的存在是牙周病的危险因素，应定期进行洗牙。
因为牙结石形成以后，无论是龈上牙石还是龈下牙石，都是无法通过刷牙的方法去除的，必须进行洁治术才能够去除牙结石。