奥司他韦是治疗流行性感冒最常用和最主要的用药，连用5天。奥司他韦不良反应少，临床上常遇到的副作用还是以消化系统最为常见如恶心、呕吐、腹部闷痛、腹泻等。
呼吸系统症状，可以诱发咳嗽的加重，偶有心慌、胸闷感。少见的精神神经系统症状如眩晕、头痛、失眠、乏力、行为异常、谵妄等，少数患者还可以出现皮疹、皮炎、荨麻疹等。
上述不良反应的发生可能与患者年龄、肝肾功能的情况、用法、用量等有一定关系，因奥司他韦的药理及副作用，临床上主要是用于流行性感冒的治疗，而普通的感冒不建议使用。