葡萄糖酸锌属于矿物质类非处方药，上市后的不良反应报告显示，按照说明书推荐的剂量和疗程使用比较安全，患者普遍耐受性良好，不良反应较小，偶见患者服药后会出现轻度的恶心、呕吐、便秘等消化道反应。
对于出现胃肠道不良反应的患者，或者平时脾胃功能较弱的患者，饭后服用可以减少锌剂对胃肠道的刺激。极少数患者服药后还会出现皮疹、瘙痒等不良反应，对此药过敏者禁用。注意此药虽然是非处方药，但在应用前必须确诊一下是否是缺锌症，确诊后再使用，如需长期服用，必须在医生的指导下进行，市场上还有葡萄糖酸锌的保健品，要正确使用保健品葡萄糖酸锌和药品葡萄糖酸锌。