葡萄球菌感染根据不同的耐药性，可选择以下抗生素：
1、如果是比较敏感的细菌，也就是对甲氧西林不耐药的葡萄球菌，这种情况可以应用苯唑西林、头孢唑林或者选用双氯西林。
2、如果感染的葡萄球菌对甲氧西林耐药，比如耐甲氧西林的金黄色葡萄球菌，也就是MRSA，需要应用万古霉素、替考拉宁、利奈唑胺、达托霉素，或者奎奴普丁-达福普丁。
3、如果感染的细菌对万古霉素耐药，这种情况需要应用利奈唑胺或者达托霉素。
4、如果感染的耐药菌病情非常严重，这种情况也可以联合利福平、米诺环素或者氨基糖苷类药物。