调节肠胃功能紊乱和消化不良，可以采取一些方法：
第一、要建立良好的生活习惯，避免烟、酒和服用非甾体类消炎药对胃肠道产生刺激，要避免生活经历中会诱发肠功能紊乱症状的食物。要根据患者不同的特点进行心理治疗，对于失眠和焦虑者可适当的给予真菌的药物。
第二、可以针对相应的症状采取一些药物治疗。对于有上腹痛、上腹烧灼感为主要症状的患者可以给予抑制胃酸分泌的药物，比如奥美拉唑、雷贝拉唑等等。对于有餐后饱胀、早饱为主要症状的患者可以给予促胃肠动力的药物，比如多潘立酮、莫沙必利，同时也可以根除幽门螺杆菌治疗，对于一部分有幽门螺杆菌感染的患者，根除幽门螺杆菌之后症状可以得到明显的缓解。如果有明显的抑郁症状也可以给予相应的三环类抗抑郁药物改善症状，同时还可以给予改善消化功能的药物，比如复方消化酶胶囊，以及调节肠道菌群的药物，比如益生菌等等。