非典型滤泡上皮细胞指的是滤泡上皮细胞出现了不正常的情况，比如出现形态学的异常改变，也就是细胞外部形态发生了改变，是由于这种细胞的内部含有滤泡，常见的有甲状腺滤泡上皮，可以分泌出激素。
但是如果这个滤泡上皮细胞因为受到激素的影响、环境的突然间恶化，以及受到遗传因素的影响，极有可能会出现异常变化，但是异常变化的细胞数量比较少，所以情况严重程度还需要根据患者的包块大小、程度，以及分级指数来判断，最好可以定期复查以及随访，因为情况严重的还有可能是癌变的可能性。所以一旦出现此情况，最好是去医院做进一步的检查治疗。