随着医疗技术的进步，胃肠镜检查目前相对比较安全，但仍存在一定的风险，所以在检查前一定要与患者或家属给予详细的沟通，签署知情同意书方可进行检查，具体危害如下：
1、胃出血、胃穿孔：胃镜检查可能因胃黏膜的损伤而出现胃出血，或者因为胃壁比较薄、胃溃疡比较深，可能会发生胃穿孔。
2、麻醉风险：对于心肺功能比较差的患者，还有麻醉的风险。
3、恶心、呕吐：若行普通胃镜，检查过程中患者常常会有恶心、呕吐，检查中要给予安抚情绪，减轻患者紧张情绪，提高配合率，若对恶心、呕吐耐受性非常差，建议进行无痛胃镜检查。