霉菌性阴道炎在怀孕以后容易发病，主要的治疗方法是以阴道上药为主，不建议口服用药。口服用抗真菌药物，在怀孕以后有可能对胎儿造成影响，所以在孕期不能够口服用药，主要是阴道上药。抗真菌药物目前常用的药物有克霉唑栓，或者制霉菌素栓阴道上药，上药之前可以考虑用外洗液冲洗阴道，然后再进行阴道上药。上药以后至少要在床上静卧两个小时，以利于药物的吸收。
第二天早上起床以后，可以建议用阴道冲洗将药物残渣冲洗掉，以防止药液流到外阴，引起药物性过敏性外阴炎。霉菌性阴道炎治疗周期是5-7天，在怀孕以后由于女性的雌孕激素增加，雌激素引起阴道上皮细胞增生加快，孕激素增加导致阴道上皮细胞的脱落加快，从而引起阴道上皮细胞增生脱落都加快，导致白带增多。在这时候阴道内环境的改变，从而引起霉菌性阴道炎高发。在孕期霉菌性阴道炎的反复发作，主要是由生理因素所造成，对孕期霉菌性阴道炎的治疗主要是以对症治疗为主，反复发作就是一个生理性因素，建议在这个时候尽量的不要用护垫，注意保持外阴的干燥，勤换内裤，内裤多晒太阳也可以杀灭霉菌。