根尖周囊肿不能通过根管治疗治愈，因为根管治疗是将根尖周围的炎症或者液体，通过根管引流到口腔中，从而控制根尖周围的炎症。而根尖周囊肿由囊壁和囊液两部分组成，如果单纯把囊液通过根管引流干净，囊壁仍然存在于根尖周围，剩余的囊壁还会不断分泌囊液，随着时间推移囊肿又会重新复发，而且不断扩大。所以根尖周囊肿的治疗原则是手术切除，只有通过手术把囊壁完整摘除，才能彻底治疗根尖周囊肿。目前根尖周囊肿有两种治疗方法：第一、通过手术将囊肿以及囊肿的牙齿一起摘除；第二、将牙齿进行根管治疗，进行根尖切除，将囊肿切除。