月经不调的诊断主要是根据病史、体格检查，以及辅助检查，所以对于有性生活的女性进行常规的妇科检查，主要是为了排除生殖系统的器质性病变。对于没有性生活的女性，一般禁止行妇科检查。如果怀疑有生殖系统的器质性病变，可以采用肛诊或者直肠腹部诊等。
月经不调诊断的常规辅助检查包括血常规、妊娠试验、超声，以及诊断性刮宫。诊断性刮宫主要适用于年龄＞40岁或者围绝经期的女性，当子宫内膜厚度＞12mm，药物治疗无效，怀疑有子宫内膜癌的高危因素时，应该采用诊断性刮宫。但是对于未婚的患者，如果怀疑有器质性病变，需要征得患者及家属的同意后才可以行诊断性刮宫。诊断性的刮宫是为了止血，以及获取子宫内膜组织送病理检查，确诊子宫内膜是否有病变。
所以对于月经不调的诊断，需要采用多种检查手段进行综合的判断和考虑。