一般来说，无论是使用艾滋病检测试纸，还是在医院或疾控中心抽血进行艾滋病的初筛，都有极低的几率会出现假阳性的结果，主要原因可能是检测试纸或初筛检测的灵敏度极高，但是特异性相对差一些。还有可能是患者有其他的疾病形成的一种交叉反应，导致假阳性结果出现。再者是患者长期服用某些药物，对检测结果可能也会造成一定的影响。所以通常对于初筛阳性的病例，都需要到疾控中心进行确证试验，进一步验证结果是否准确，经过疾控中心再次检验，就可以发放阴性或者阳性的确认报告，基本不会出现误诊。
实际上在艾滋病检查过程中出现假阳性的可能性极微小，反而出现假阴性的情况比较多。出现假阴性的情况主要是与检测时间有关，如果过早进行检测，由于HIV抗体产生的量还不足以被检测试剂捕捉到，所以就会出现阴性的结果，在窗口期之内检测时容易出现假阴性的结果。所以在窗口期内检测结果是阴性时，不能完全排除HIV感染。