低烧、头疼不一定是感染了新冠肺炎，可能是其他疾病所导致，常见的其他疾病如下：
1、受凉感冒：此时要做的是加强对症处理，注意休息，多喝温开水，可服用中成药抗感冒治疗，如板蓝根颗粒。
2、感染肺结核：出现低烧、头疼的表现，一般还会伴有盗汗、乏力的症状，PPD试验多呈阳性，有时候痰里面可以找到结核杆菌，要积极抗结核治疗。
如果患者近期到过疫区，或者跟感染新冠肺炎的患者有密切接触史，出现低烧、头痛的情况，就要及时到发热门诊进行检查，完善新冠肺炎核酸检测，必要时完善胸部CT、血常规等检查。如果新冠肺炎核酸检测是阳性，就可以确诊感染了新冠肺炎，必须采取隔离治疗的措施，防止疾病传染给其他人群。在医生的指导下，采取有效的处理措施，使疾病得到有效控制。