乙肝DNA查的是乙型肝炎病毒在体内的载量。乙肝DNA是乙肝肝炎病毒的核酸，通常病毒是一种个体微小、结构简单、只含一种核酸，是DNA或者是RNA，而且必须在活细胞内寄生，并以复制的方式增殖的非细胞型生物。掌握乙型肝炎病毒在体内的载量，可以确定是否需要抗病毒治疗，高载量的乙型肝炎病毒，与肝硬化和肝癌呈正相关，所以高载量的乙型肝炎病毒需要进行抗病毒治疗。
抗病毒治疗的目标是最大限度、持久地抑制乙型肝炎病毒复制，减少肝硬化和肝癌的发生。在抗病毒治疗期间，也应该定期进行HBVDNA检测，建议每三个月进行一次检查，除了检查HBVDNA之外，还要检查肝功、甲胎蛋白、肝脏彩超等。抗病毒治疗可以应用干扰素，或者是恩替卡韦、替诺福韦，恩替卡韦和替诺福韦属于核苷类抗病毒药物，在应用期间不能擅自停药，擅自停药会增加耐药的风险，会给今后的治疗增加难度。