PET-CT对身体的伤害主要是指射线对人体的损伤，射线大概包括两部分，一部分是在扫描的过程中使用的CT机，对人体造成的辐射损伤。另一部分是在检查的过程中，患者所服用的放射性核素对人体的损伤。
CT对人体的损伤在检查至结束之后就消失了，而且这种损伤对人体是比较小的，放射性核素对身体的辐射会持续两天，因为核素在人体内要有一个代谢的过程，一般24-48小时之后就可以完全的排出体外。为了减少放射性核素对人体的损伤，建议患者在检查结束之后多喝点水，或者是牛奶，多吃点新鲜的蔬菜和水果。