新生儿采足跟血筛查的主要项目有新生儿先天性的甲状腺功能低下症、苯丙酮尿症、先天性肾上腺皮质增生症和半乳糖血症，因为这些疾病都是可防、可治，早期发现、早期治疗，在新生儿期后不会留下严重的后遗症，生长发育可以达到和正常同龄儿相似，尤其是先天性的甲状腺功能低下症，如果在新生儿生后三个月才开始发现进行治疗，对新生儿期后的智能发育是有影响，可能会造成智力发育落后。
如果在生后一岁才开始进行治疗，此时就会影响婴儿的生存期。苯丙酮尿症都可以采取特殊的饮食治疗，不影响新生儿在以后婴儿期或幼儿期的智能发育。