遗精以后如果出现尿道疼痛，需要到医院的泌尿外科进行诊治，常常要进行尿常规检测，一般来说引起遗精后尿道疼痛的原因，主要是由于泌尿系统的炎症，包括尿道炎、前列腺炎或精囊炎。
当出现炎症时治疗的方法主要是以口服药物为主，包括中药和西药，中药主要是选择清热解毒、利尿通淋的药物，常用的中药有热淋清颗粒、八正胶囊或癃清片。
西药主要是针对细菌感染引起的炎症，常常选择的西药有头孢地尼胶囊、左氧氟沙星或盐酸米诺环素，在服用西药的过程中不要饮酒、不吃辛辣刺激类食物。