肛门脓肿手术后需要多长时间恢复，需要根据患者自身的实际情况以及手术切口的情况而定。一般如果肛门脓肿发病位置较浅，手术切口的位置也就不会太深，不会对肛门括约肌造成损伤，这种情况下在手术之后所需要的恢复时间就比较的短，一般7-15天基本就可以恢复。
如果肛门脓肿发病的位置比较深，在手术时就需要做较深的切口，也会对肛门括约肌造成一定的损伤，这种情况下恢复期就会比较长，特别是肛门括约肌容易受到排便的影响，恢复的会比较慢，大约需要一个月左右的时间。如果有糖尿病或者结核病的情况，自身的代谢功能较差，在肛门脓肿手术之后，恢复所需要的时间会更长，有的会长达三个月。