细针穿刺和粗针穿刺最主要的区别是使用器械是不一样的。细针穿刺使用的是普通的注射器，针头的口径就是我们平常临床上用的注射器的针头，对组织的刺激比较小。粗针穿刺是使用的特制的针头，粗针的口径可能会比较粗，通常来讲对组织的刺激性要比较大。但是粗针穿刺能够获得更多的充分的组织量来满足病理和诊断上的要求。另外粗针穿刺也需要进行局部的麻醉，来减轻粗针穿刺对于病人的疼痛刺激。