女变男的手术是变性手术当中是最困难的一类手术，技术要求和技术含量都会相对的更高一些。女变男的手术整体下来包括有几期，先要把子宫和卵巢、阴道切除，这部分往往是由妇产科的大夫来完成的。接下来是乳房切除、阴茎再造，这两个顺序谁在前，谁在后都OK的。
平胸的手术，也是需要完整的住院经历手术。还有是要进行阴茎再造，阴茎再造要根据不同的病人选择不同的方法，有的可能选用前臂皮瓣做阴茎再造，有的可能需要用股前外侧皮瓣做阴茎再造，根据病人的身体条件、脂肪的厚度、意愿、术后外形的一些要求来综合判断和决定。
总的来说，对于女变男的病人来说，前后要至少进行3次手术才能够最终完成。