内睑腺炎是否可以自愈，主要取决于患者的抵抗力以及引起睑腺炎的细菌毒力强弱。对于绝大多数的患者而言，需要酌情使用抗生素药物予以治疗来缩短病程。如果患者的抵抗力比较强，引起睑腺炎的细菌毒力也比较弱，在脓液吸收或者排除之后，炎症会基本消退而自愈。
对于大多数内睑腺炎的患者而言，需要进行治疗，特别对于儿童、老年人，或者患有糖尿病等慢性消耗性疾病的患者，由于他们的体质相对弱，抵抗力差，当感染致病毒素比较强的致病菌时，内睑腺炎通常不会自愈。情况严重者，还可以在眼睑皮下组织扩散，发展为眼睑蜂窝组织炎，如果不及时处理，有可能会引起败血症等十分严重的并发症而影响生命。
患者在早期应该予以局部的热敷，并配合使用抗生素眼药水眼膏来控制感染。情况严重者需要全身应用抗生素药物治疗，以便控制感染，必要时需要通过手术切开排脓，所以不是所有的内睑腺炎都可以自愈。