部分小三阳患者可以实现自然阴转，根据乙肝病毒感染的病程，转阴几率会有所区别，乙肝病毒感染常表现为以下两个病程：
第一、急性乙肝病毒感染：感染年龄越大，自然阴转的几率越高，成人或青少年感染乙肝病毒后，90%-95%的患者可以实现表面抗原阴转。对于婴幼儿，大约有70%-75%的人可以实现表面抗原阴转，围生期感染仅有10%可以实现表面抗原阴转。对于急性乙肝病毒感染者，本身属于自限性病程，不需要抗病毒治疗。
第二、慢性乙肝病毒感染：乙肝病毒感染后病程超过六个月，认为是慢性乙肝病毒感染。成年人慢性乙肝病毒感染，每年仅有0.1%-1%的患者可以实现表面抗原阴转，其它患者经过抗病毒后，部分能实现表面抗原阴转。