十二指肠溃疡引起的疼痛一般情况因为饥饿时胃肠内容物快排空时，胃肠继续分泌消化液，消化液是酸性，这样会刺激溃疡面而出现疼痛。
消化性溃疡的治疗原则是抑制胃酸分泌、解痉、保护胃黏膜、清除幽门螺杆菌、去除病因及治疗原发病，常用的治疗包括一般治疗、药物治疗。
一般治疗如消化性溃疡属于心身疾病，生活规律，忌辛辣刺激食物，避免过度紧张。
药物治疗，比如减少胃酸分泌的药物主要是雷尼替丁、奥美拉唑等，解痉止痛药物如颠茄、山莨菪碱等，增加黏膜防御能力药物主要有胶体铋剂，抗幽门螺旋杆菌感染药物常用三联或四联药物疗法，包括奥美拉唑、克拉霉素、阿莫西林三联药物疗法。