肛门镜属于一种侵袭性的医疗器械，只要是在规范的医疗机构进行操作，器械都是按照标准消毒的流程进行处理。艾滋病病毒对外界的抵抗力低，常规的消毒措施完全可以灭活艾滋病病毒，所以在规范的医疗机构应用就没有被传染的可能。但是艾滋病可以通过血液途径传播，所以尽量还是要避免不必要的侵袭性医疗操作，尽量避免不必要的静脉注射，尽量减少输血和应用血制品的治疗手段。
曾经通过输血和应用血制品，是感染HIV病毒经血液途径传播的主要途径，目前由于血源筛查方式的改变，此种途径已经得到了有效控制。目前共用针具进行特殊药品注射的人群，是艾滋病的高发人群。纹身、修足、修牙等也有潜在风险，与艾滋病病人共用刮脸刀、牙刷、剃须刀等，也有潜在风险。在艾滋病发现的40年时间里，我国艾滋病的传播从开始的经血液途径传播，目前已经转变为主要通过性接触传播。