治疗内分泌失调的方法，要取决于是哪一种内分泌失调，这个方法是有所不同的。内分泌腺体非常多，每个内分泌腺体都可以分泌内分泌激素。分泌的内分泌激素不足叫内分泌功能减退，分泌内分泌激素过多叫内分泌腺体的功能亢进。
从人体的内分泌系统来看，主要有下丘脑神经内分泌、垂体的内分泌腺体、甲状腺所分泌的内分泌激素、胰腺分泌的内分泌激素、肾上腺所分泌的内分泌激素，还有男性和女性的性腺所分泌的内分泌激素。所以根据以上主要的人体内分泌腺体所分泌激素的功能正常与否，称为内分泌失调与否，给予相应的靶器官激素的替代治疗。
如果分泌的功能减退给予相应的激素替代治疗，如果分泌的功能亢进，所分泌的内分泌激素超过身体的需要剂量，可以给予抑制内分泌腺体分泌相应内分泌激素的治疗方法。