精囊炎分为急性精囊炎和慢性精囊炎，急性精囊炎有可能治愈，而慢性精囊炎治疗非常棘手。
急性精囊炎的治疗和处理，与急性前列腺炎相似，包括一般的支持疗法，比如卧床休息、碱化尿液、输液、解痉止痛、保持排便通畅、热水坐浴等。不过最主要的治疗是选择敏感抗生素静脉给药，及时控制感染。如果有脓肿形成，需要穿刺抽吸减压或者切开引流。如果治疗及时，急性精囊炎大多数在两周左右会明显好转，一般巩固1-2个月以后基本上能够治愈。
但是慢性精囊炎和慢性前列腺炎一样，治疗非常困难。治疗效果常常不能令人满意，因此目前主要采用全身与局部中西医结合的综合治疗，包括口服抗生素、雌激素、糖皮质激素，以及局部栓剂、热水坐浴、理疗、支持治疗以及精神心理疗法。对非特异性慢性精囊炎，不主张手术治疗。如果并发精囊脓肿，需要手术引流，并发精囊结石可以做精囊镜。