小儿甲亢的治疗和成人不一样。在口服药、手术切除以及核素碘治疗三者中，首选口服药，一般需要口服治疗2-3年，如果是因为桥本氏病导致的可以缩短。疗法的选择应该根据小儿的年龄、病程、甲状腺功能亢进的类型、甲状腺的大小、药物反应、有无桥本氏病、家长能否坚持治疗等。仅在药物治疗无效的时候才考虑手术或用核素碘疗法。一般治疗在疾病期间应该注意休息，避免外来的刺激和压力。饮食应该富有蛋白质、糖类及维生素类。另外，可以选用他巴唑，此药物可以阻滞碘与酪氨酸的结合，效果非常好。