喝蛋白粉腹泻与本身肠道功能紊乱、炎症有关，部分人是服用过量、对蛋白粉有过敏反应导致的。正常情况下喝蛋白粉是不会造成腹泻症状的，但是有部分人身体上会伴随有肠胃功能紊乱，这些人会因为肠道蠕动速度过快，所以会将摄入体内的食物快速排泄出来，而出现腹泻的症状。
另外当肠道系统存在有炎症时，吃任何食物都会有腹泻的症状，这时喝蛋白粉也会引起腹泻，部分人是由于对蛋白质有过敏反应引起的，这些人在喝了蛋白粉之后，肠胃系统会因为过敏的因素而出现腹泻。有部分人吃蛋白粉时会大量食用，因此导致肠胃负担加重引起消化不良，也会出现腹泻的症状。