患者出现扁桃体发炎时，发生疼痛的主要是咽喉部位。部分患者如果咽喉疼痛较重，可能会造成吞咽、进食困难，也有部分患者会进一步出现畏寒、发热、头痛、全身无力等表现。患者可能表现为单侧的扁桃体急性炎症，也可能两侧扁桃体都有急性炎症感染的状况。
扁桃体表面还可能有脓性分泌物附着，部分患者还会有扁桃体周围炎、扁桃体周围脓肿等局部并发症，往往出现于一侧，导致吞咽疼痛程度更为剧烈，甚至会引起张口受限的情况。患者需要给予积极抗感染的治疗措施，甚至需要进行切开引流、穿刺抽脓的治疗。