门静脉癌栓往往发生于原发性肝癌病人，原发性肝癌的癌细胞形成癌细胞团，可以出现在门静脉血管里面，阻塞门静脉血流形成癌栓，此时若给病人做B超、增强CT，或者增强核磁共振检查，就可以发现门静脉具有充盈缺损。
门静脉癌栓的出现，往往意味着原发性肝癌预后不良，此时的原发性肝癌多已经进入了局部晚期或者晚期阶段，失去了治愈机会。所以门静脉癌栓属于原发性肝癌常见并发症，是影响原发性肝癌预后非常重要的因素。具有门静脉癌栓的患者，常会发生肝内播散和转移，需要给予积极治疗。