如果精子的畸形率是98%，属于不正常。根据《世界卫生组织人类精液检查与处理实验室手册(第5版)》精液质量分析标准，正常成年男性的精子畸形率不能超过96%，也就是在进行精液检查的时候，形态正常的精子要达到4%以上。一般来说，有生育力的男性，精子正常形态的中位数为15%。异常形态的精子，包括头部异常、颈中段异常和尾部异常等。
精子的形态学是评价精液质量的重要指标，精子的畸形率越高，女性受孕的几率就越小。如果精液中正常形态的精子数量减少，与睾丸附睾的功能异常有关，比如与生殖器官先天发育异常、生殖器官的感染、精索静脉曲张、雄性激素水平异常、某些理化因素的刺激，以及药物等因素有关。