核素检查的危害主要有两方面，包括患者在服用完放射性元素进行扫描的过程中仪器对身体的辐射作用，但是这种辐射只限于患者本人。
还有患者服用核素检查之后，由于体内残留的放射性元素，还会对患者以及周边的人造成放射性的损害。
但是由于放射性元素的半衰期很短，所以检查结束之后患者体内大部分的放射元素就已经基本代谢掉，它对患者本身以及周边的人的损害都不是很大。但是安全起见，核素检查之后的患者在两天之内不建议接触孕妇以及婴幼儿。