儿童感染支原体，感染的患者是主要传染源，可通过飞沫经呼吸道传播，各年龄段人群对其普遍易感，儿童是最易感的人群，发病高峰年龄是学龄前期和学龄期儿童。3-15岁儿童的社区获得性肺炎中，8%-40%由支原体感染引起，但反复感染者少见。
支原体感染全年散发，我国北方以冬季，南方以夏秋季为多。在社区、家庭内或聚集人群中可以有流行感染，爆发则多在学校、幼托机构、夏令营等较封闭的群体中。婴幼儿常表现为轻症感染，支原体在呼吸道潜伏期为2-3周。小儿肺炎支原体肺炎随着平均温度和相对湿度的增高而增多，温度和湿度对小儿肺炎支原体肺炎的影响还存在滞后效应，温度的滞后效应为0-1周，湿度的滞后则长达3-8周。