胃镜检查可以查出食道和咽喉疾病，如果看咽喉疾病，不如专用的喉镜观察的更细致、直观，并且喉镜做咽喉部检查刺激性小，患者配合度高。胃镜检查时看咽喉部处，患者常常会有恶心、呕吐，如果在咽喉部停留时间过长，会使患者极为不适。若有咽喉部的症状，还是要挂耳鼻喉科，进行专业的喉镜检查更合适。
胃镜检查对食道、胃、十二指肠都有非常清晰的效果，并且可以直观的观察病变的形态，可以在胃镜下取病理活检或进行内镜下治疗，目前临床应用非常广泛，也使很多食管癌、胃癌，以及十二指肠肿瘤的患者能够被早期发现、早期诊断，给予及早的治疗，提高了患者的生存率，延长生存时间。