肾结石和肾积水的症状有很大的个体差异，主要与结石引起的梗阻部位、程度，以及时间长短等因素有关，有的患者甚至没有症状。如果肾结石造成上尿路急性梗阻，引起肾积水，会引起肾绞痛。症状表现为突然发作的腰部刀割样疼痛，通常向下腹部或腹股沟部进行放射。疼痛的症状呈阵发性发作，同时伴有恶心、呕吐或者血尿等症状。
如果是肾结石造成上尿路的慢性梗阻，引起肾积水。由于疾病发展缓慢，症状一般不明显，或者仅有轻微的腰部隐痛不适。如果是肾结石、肾积水继发感染，出现急性肾盂肾炎的表现，比如寒战、高热、腰痛、恶心、呕吐等症状。