婴儿便秘常见的原因是分为两种类型，一个是器质性的便秘，一个是功能性的便秘。
首先来说功能性的便秘，婴幼儿的功能性便秘，大多数都和不正当的喂养，不正常的饮食习惯和排便习惯有关系，比方说小孩特别爱吃零食，不爱吃水果和蔬菜，不爱养成定时去排便的习惯，甚至是贪玩，该排便的时候不愿意到厕所去排便，这些都会引起便秘。
在这种情况下，必须在辅食中适当的增加蔬菜和水果，让小孩定时排便，不爱贪玩，同时尽量不要吃那么多的零食，这是婴幼儿便秘，功能纤维的治疗。
另外一种是器质性便秘，最常见的是先天性肛门疾病，特别是肛门直肠狭窄，发病率并不高，但是也有。如果到医院确定是肛门狭窄，做个非常简单的小手术，扣合肛，或者是做简单的狭窄的切开松解术，都能够达到纠正便秘的目的。
比较疑难的问题，叫先天性巨结肠病，发病率也不高，但是治疗起来相对棘手，婴幼儿年龄比较低，一旦确诊往往是需要手术治疗的。