红斑狼疮的病因现在尚未完全明了，目前认为与三种因素有关。一是遗传因素。红斑狼疮的发病有家族聚集倾向，0.4%-5%的患者的一级或二级亲属患有红斑狼疮或其它自身免疫性疾病。二是性激素。本病多见于育龄期女性，妊娠可诱发或加重，尽管动物试验表明雌激素可使小鼠病情加剧，雄激素则可缓解其病情，但性激素与本病病因的关系证据尚不足。三是环境因素及其它因素。紫外线照射可改变皮肤组织中的DNA的化学结构，增加其免疫原性，从而继发或加重。某些药物如普鲁卡因、甲基多巴、异烟肼、青霉素等，可诱发药物性红斑狼疮，某些感染如链球菌、EB病毒等，也可诱发或加重本病。