大三阳、小三阳携带者如果没有出现肝功能的异常、肝炎的发作，不需要任何治疗。如果出现了肝炎发作，如急性肝炎或者慢性的肝炎，出现了转氨酶的升高、胆红素的升高，就需要口服抗病毒药物进行治疗。一线的抗病毒药物包括恩替卡韦及替诺福韦，能够有效的抑制乙肝病毒的复制，延缓肝纤维化、肝硬化的发展，并且降低肝癌的发生概率。
乙肝携带者在肝炎发作后，还需要口服抗病毒药物进行长期的治疗，因为目前的抗病毒药物不能够彻底清除乙肝病毒，只能够抑制乙肝病毒的复制，因此大部分乙肝携带者为终身携带病毒的状态，建议每半年定期进行肝病的体检。如果体检当中发现有肝病的发作，就需要及时治疗。