13价疫苗接种是肌肉注射，婴儿最佳的接种部位是大腿前外侧，幼儿为上臂三角肌，接种对象是6周龄到15月的婴幼儿。免疫程序和剂量是基础免疫，第2、4、6月龄各接种一支，首剂最早可以在六周龄接种，之后各剂间隔4-8周，加强免疫可以在12-15月龄接种一剂。
全程接种之后可产生持久免疫力，不再接种。13价疫苗可以预防由13个肺炎球菌型引起的侵袭性疾病，包括结节状肺炎、脑膜炎、败血症和菌血症等。