生殖器疱疹是一种由单纯疱疹病毒感染所引起的性传播疾病，主要的临床表现是在外生殖器及肛门周围出现群集性的水疱，有时候临床症状不典型，就需要通过实验室的检测来辅助诊断，以前比较常用的是细胞学的检查法，在局部刮片检测是否有病毒感染的多核巨细胞，判定是否是疱疹病毒感染，但是敏感性不高。
此外，通过血清学的方法，抽血查单纯疱疹病毒Ⅰ型和Ⅱ型的抗体进行检测，比较敏感，还有最新的方法，即检测单纯疱疹病毒的DNA，可以通过PCR等方式检测，敏感性很高。如果能测到局部有单纯疱疹病毒的DNA，基本就可以确定患者是感染了单纯疱疹病毒，生殖器疱疹的诊断基本也是可以确定的。