腱鞘囊肿发生恶变的几率是极小的，几乎不会产生病变。腱鞘囊肿是骨科一种比较常见的疾病，通常是由于患者患处存在外伤、受凉或者过度使用等一些因素，影响腱鞘或者腱鞘内部的肌腱，从而产生炎症所引起的，局部表现包括肿胀、狭窄、疼痛、活动受限等一系列症状，如果不能及时进行治疗，会导致病情加重或者迁延不愈，但是这种疾病为良性疾病，基本是不会发生恶变的。
在某些极端情况下，例如反复发生感染或者某些皮肤的癌变，有可能导致腱鞘囊肿发生恶变，但是这种几率是极小的。综上所述，可以看出腱鞘囊肿基本不会发生恶变，建议患者患有该类疾病应当及早就诊，明确病情部位以及严重程度，在医生指导下进行针对性治疗。